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| Registros recuperados : 45 | |
| 3. |  | MENESES, P. H. S.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. D. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SAMPAIO, A. C. F.; MEDEIROS, R. D. de. Consórcio soja-teca em sistema integração lavoura-pecuária-floresta. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 4. | | MEDEIROS, R. D. de; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; SILVA, A. P.; MORINIGO, E. E. V. Consortium corn-teak in crop-livestock-forest integration system in the state of Roraima. In: CONGRESSO MUNDIAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO LAVOURA PECUÁRIA, 3., 2015, Brasília. Rumo à intensificação sustentável, 2015. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 5. | | RIBEIRO, C. M. C.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; MIRINIGO, E. E. V.; MEDEIROS, R. D. de. Comparação de dois anos de cultivo da soja em sistemas de plantio direto em sucessão ou não com a cultura do milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 6. | | SAMPAIO, A. C. F.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; RIBEIRO, T. T. S.; MEDEIROS, R. D. de. Adubação potássica e local de semeadura do milho cultivado em sucessão a melancia no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 7. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MENEZES, P. H. S.; SILVA, J. A. da; MEDEIROS, R. D. de. Adubação de Ribumin na cultura da melancia no cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 8. | | SAMPAIO, A. C. F.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MENESES, P. H. S.; MEDEIROS, R. D. de. Influência de dois anos de cultivo no plantio direto da soja no Cerrado de Roraima. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 9. | | SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SAMPAIO, A. C. F.; MENESES, P. H. S.; MEDEIROS, R. D. de. Milho consorciado com eucalipto em sistema integração lavoura-pecuária-floresta. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 10. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; BARRETO, G. F.; SILVA, A. P. da; MEDEIROS, R. D. de. Milho em consorcio com cedro e castanheira em sistemas In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 11. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MEDEIROS, R. D. de; MENEZES, P. H. S. de; RODRIGUEZ, C. A. Características agronômicas de cultivares de melancia nas condições do cerrado de Roraima, Brasil. Scientia Agropecuaria, v. 8, n. 3, p.193-201, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 12. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SAMPAIO, A. C. F.; MENESES, P. H. S. de; MEDEIROS, R. D. de. Rendimento de mandioca consorciada com melancia em diferentes arranjos de plantio no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 16.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO E CARIBENHO DE MANDIOCA, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda: anais. Foz do Iguaçu: SBM, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 13. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L; NASCIMENTO, F. R. do; MORINIGO, E. E. V.; MEDEIROS, R. D. de. Rendimento de mandioca consorciada com melancia em diferentes épocas de plantio no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 16.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO E CARIBENHO DE MANDIOCA, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda: anais. Foz do Iguaçu: SBM, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 14. | | PORTO, D. S.; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; MEDEIROS, R. D. de. Rendimento da melancia sob doses de fósforo e de potássio no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 15. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MEDEIROS, R. D. de; ALVES, A. K. S.; CUNHA, L. R. de A. Rendimento de soja consorciada com teca em sistema integração lavoura-pecuária-floresta em Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 16. | | SAMPAIO, A. C. F.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MENESES, P. H. S.; MEDEIROS, R. D. de. Qualidade de frutos de cultivares de melancia no Cerrado de Boa Vista, Roraima. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 17. | | SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SAMPAIO, A. C. F.; MENESES, P. H. S.; MEDEIROS, R. D. de. Qualidade de frutos da melancia em consórcio com mandioca em diferentes épocas de plantio no Cerrado de Roraima. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 18. | | MEDEIROS, R. D. de; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; NASCIMENTO, F. R. do; SILVA, A. P. da. Qualidade de frutos de melancia sob plantas de cobertura e doses de nitrogênio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 19. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, A. P. da; SILVA, E. S. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; EVALD, A.; MEDEIROS, R. D. de. Produção de melancia adubada com diferentes doses de Ribumin@ no cerrado de Roraima. In: SEMANA TECNOLÓGICA DO CAMPUS DE MURUPU. 3., 2014, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: Eagro/UFRR, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 20. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; SILVA, A. P. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; NASCIMENTO, F. R. do; MEDEIROS, R. D. de. Produção de melancia adubada com fósforo e potássio na Savana de Roraima. In: SEMANA TECNOLÓGICA DO CAMPUS DE MURUPU. 3., 2014, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: Eagro/UFRR, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| Registros recuperados : 45 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
16/11/2018 |
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Data da última atualização: |
11/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
ALESSI, A. M.; BIRD, S. M.; OATES, N. C.; LI, Y.; DOWLE, A. A.; NOVOTNY, E. H.; AZEVEDO, E. R. de; BENNETT, J. P.; POLIKARPOV, I.; YOUNG, J. P. W.; MCQUEEN-MASON, S. J.; BRUCE, N. C. |
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Afiliação: |
ANNA M. ALESSI, UNIVERSITY OF YORK; SUSANNAH M. BIRD, UNIVERSITY OF YORK; NICOLA C. OATES, UNIVERSITY OF YORK; YI LI, UNIVERSITY OF YORK; ADAM A. DOWLE, UNIVERSITY OF YORK; ETELVINO HENRIQUE NOVOTNY, CNPS; EDUARDO R. DE AZEVEDO, USP; JOSEPH P. BENNETT, UNIVERSITY OF YORK; IGOR POLIKARPOV, USP; J. PETER W. YOUNG, UNIVERSITY OF YORK; SIMON J. MCQUEEN-MASON, UNIVERSITY OF YORK; NEIL C. BRUCE, UNIVERSITY OF YORK. |
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Título: |
Defining functional diversity for lignocellulose degradation in a microbial community using multi-omics studies. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Biotechnology for Biofuels, v. 11, article 166, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s13068-018-1164-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Lignocellulose is one of the most abundant forms of fixed carbon in the biosphere. Current industrial approaches to the degradation of lignocellulose employ enzyme mixtures, usually from a single fungal species, which are only effective in hydrolyzing polysaccharides following biomass pre-treatments. While the enzymatic mechanisms of lignocellulose degradation have been characterized in detail in individual microbial species, the microbial communities that efficiently breakdown plant materials in nature are species rich and secrete a myriad of enzymes to perform "community-level" metabolism of lignocellulose. Single-species approaches are, therefore, likely to miss important aspects of lignocellulose degradation that will be central to optimizing commercial processes. Results: Here, we investigated the microbial degradation of wheat straw in liquid cultures that had been inoculated with wheat straw compost. Samples taken at selected time points were subjected to multi-omics analysis with the aim of identifying new microbial mechanisms for lignocellulose degradation that could be applied in industrial pretreatment of feedstocks. Phylogenetic composition of the community, based on sequenced bacterial and eukaryotic ribosomal genes, showed a gradual decrease in complexity and diversity over time due to microbial enrichment. Taxonomic affiliation of bacterial species showed dominance of Bacteroidetes and Proteobacteria and high relative abundance of genera Asticcacaulis, Leadbetterella and Truepera. The eukaryotic members of the community were enriched in peritrich ciliates from genus Telotrochidium that thrived in the liquid cultures compared to fungal species that were present in low abundance. A targeted metasecretome approach combined with metatranscriptomics analysis, identified 1127 proteins and showed the presence of numerous carbohydrate-active enzymes extracted from the biomassbound fractions and from the culture supernatant. This revealed a wide array of hydrolytic cellulases, hemicellulases and carbohydrate-binding modules involved in lignocellulose degradation. The expression of these activities correlated to the changes in the biomass composition observed by FTIR and ssNMR measurements. Conclusions: A combination of mass spectrometry-based proteomics coupled with metatranscriptomics has enabled the identification of a large number of lignocellulose degrading enzymes that can now be further explored for the development of improved enzyme cocktails for the treatment of plant-based feedstocks. In addition to the expected carbohydrate-active enzymes, our studies reveal a large number of unknown proteins, some of which may play a crucial role in community-based lignocellulose degradation. MenosBackground: Lignocellulose is one of the most abundant forms of fixed carbon in the biosphere. Current industrial approaches to the degradation of lignocellulose employ enzyme mixtures, usually from a single fungal species, which are only effective in hydrolyzing polysaccharides following biomass pre-treatments. While the enzymatic mechanisms of lignocellulose degradation have been characterized in detail in individual microbial species, the microbial communities that efficiently breakdown plant materials in nature are species rich and secrete a myriad of enzymes to perform "community-level" metabolism of lignocellulose. Single-species approaches are, therefore, likely to miss important aspects of lignocellulose degradation that will be central to optimizing commercial processes. Results: Here, we investigated the microbial degradation of wheat straw in liquid cultures that had been inoculated with wheat straw compost. Samples taken at selected time points were subjected to multi-omics analysis with the aim of identifying new microbial mechanisms for lignocellulose degradation that could be applied in industrial pretreatment of feedstocks. Phylogenetic composition of the community, based on sequenced bacterial and eukaryotic ribosomal genes, showed a gradual decrease in complexity and diversity over time due to microbial enrichment. Taxonomic affiliation of bacterial species showed dominance of Bacteroidetes and Proteobacteria and high relative abundance of genera Asticcacau... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
CAZy; Metasecretome. |
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Thesaurus NAL: |
Lignocellulose. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/186133/1/2018-044.pdf
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Marc: |
LEADER 03644naa a2200301 a 4500
001 2099501
005 2021-11-11
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
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520 $aBackground: Lignocellulose is one of the most abundant forms of fixed carbon in the biosphere. Current industrial approaches to the degradation of lignocellulose employ enzyme mixtures, usually from a single fungal species, which are only effective in hydrolyzing polysaccharides following biomass pre-treatments. While the enzymatic mechanisms of lignocellulose degradation have been characterized in detail in individual microbial species, the microbial communities that efficiently breakdown plant materials in nature are species rich and secrete a myriad of enzymes to perform "community-level" metabolism of lignocellulose. Single-species approaches are, therefore, likely to miss important aspects of lignocellulose degradation that will be central to optimizing commercial processes. Results: Here, we investigated the microbial degradation of wheat straw in liquid cultures that had been inoculated with wheat straw compost. Samples taken at selected time points were subjected to multi-omics analysis with the aim of identifying new microbial mechanisms for lignocellulose degradation that could be applied in industrial pretreatment of feedstocks. Phylogenetic composition of the community, based on sequenced bacterial and eukaryotic ribosomal genes, showed a gradual decrease in complexity and diversity over time due to microbial enrichment. Taxonomic affiliation of bacterial species showed dominance of Bacteroidetes and Proteobacteria and high relative abundance of genera Asticcacaulis, Leadbetterella and Truepera. The eukaryotic members of the community were enriched in peritrich ciliates from genus Telotrochidium that thrived in the liquid cultures compared to fungal species that were present in low abundance. A targeted metasecretome approach combined with metatranscriptomics analysis, identified 1127 proteins and showed the presence of numerous carbohydrate-active enzymes extracted from the biomassbound fractions and from the culture supernatant. This revealed a wide array of hydrolytic cellulases, hemicellulases and carbohydrate-binding modules involved in lignocellulose degradation. The expression of these activities correlated to the changes in the biomass composition observed by FTIR and ssNMR measurements. Conclusions: A combination of mass spectrometry-based proteomics coupled with metatranscriptomics has enabled the identification of a large number of lignocellulose degrading enzymes that can now be further explored for the development of improved enzyme cocktails for the treatment of plant-based feedstocks. In addition to the expected carbohydrate-active enzymes, our studies reveal a large number of unknown proteins, some of which may play a crucial role in community-based lignocellulose degradation.
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700 1 $aBRUCE, N. C.
773 $tBiotechnology for Biofuels$gv. 11, article 166, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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Registro completo
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Biblioteca(s): |
Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Trigo. |
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Identificador: |
1179 |
|
Data corrente: |
09/05/2002 |
|
Data da última atualização: |
09/05/2002 |
|
Código do título: |
0600633 |
|
Título e Subtítulo: |
AUSTRALIAN SEPTORIA NEWSLETTER |
|
Entidade: |
Wheat Industry Research Council of Australia |
|
Local de publicação: |
Australia |
|
Periodicidade: |
trimestral |
|
Coleções da unidade: |
Embrapa Trigo
1977/94 1977(7-8); 1978(9-10); 1979(11); 1980(12-13); 1981(14-16); 1982(17-18); 1983(19-20); 1984(21-22); 1985(23-24); 1986(25-26); 1987(27-28); 1988(29-30); 1989(31-32); 1990(33-34); 1991(35-36); 1992(37-38); 1993(39-40); 1994(41-42).
Classificação: 632.05 |
|
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